L’Université Norbert ZONGO compte une Ecole doctorale : L’Ecole doctorale Lettres et Sciences Humaines.
L’Ecole doctorale Lettres et Sciences Humaines est constituée des laboratoires suivants :

• Laboratoire Interdisciplinaire de didactique des disciplines « LABIDID » ;
• Laboratoire de Psychopédagogie Andragogie, mesure et Evaluation et Politiques Educatives « LAPAME » ;
• Laboratoire de Recherche en Sciences Humaines « LABOSH » ;
• Laboratoire de Recherche en Lettres, Langages, Arts et Communication « LABOLAC » ;
• Laboratoire de Recherche en Energétique et Météorologie de l’espace « LAREME » ;
• Laboratoire de Chimie des Matériaux et de l’Environnement (LACME) ;
• Laboratoire de mathématiques fondamentales et appliquées (LAMFA) ;
• Laboratoire en Sciences de la Vie et de la Terre (LASVT) ;
• Laboratoire d’Economie Régionale et Internationale (LABERI).